新政府会计制度的实施和深化,促进了我国企事业单位财务工作转变和提升。事业单位在新政府会计制度推动下积极学习和借鉴国内、国际企事业单位管理成果和方式,逐渐完善自身的内部控制系统、风险防范方式等,进而推进事业单位的常态化建设。本文对新政府会计制度下事业单位内部控制工作的局限与问题进行详细研究,并提出优化事业单位内部控制的有效方式,力求能够为事业单位内部控制工作研究提供借鉴。