甘蓝NLR家族全基因组鉴定、进化分析及在不同病害胁迫下的表达分析

作者：邢苗苗; 刘星; 孔枞枞; 杨丽梅; 庄木; 张扬勇; 王勇; 方智远^*; 吕红豪^*

来源：园艺学报, 2019, 46(04): 723-737.

DOI：10.16420/j.issn.0513-353x.2018-0804

• 甘蓝
• NLR家族基因
• 抗病
• 表达分析

从全基因组水平鉴定了87个甘蓝NLR基因家族成员,并对其进行了进化分析和表达分析。基因结构和motif组成分析表明,87个基因可分为5个亚类:NB-LRR(34个)、CC-NB-LRR(6个)、TIR-NB-LRR(45个)、RPW8-NB-LRR(1个)和CC-TIR-NB-LRR(1个);染色体定位分析表明,该家族基因在9条染色体上呈不均匀地单一或成簇分布;进化分析表明,甘蓝35个NLR基因与白菜NLR基因存在同源关系,其余52个基因为甘蓝特有;利用转录组数据分析了参与甘蓝枯萎病、黑腐病、根肿病、霜霉病、白粉病等抗性应答相关的差异表达基因,发现参与不同病害胁迫抗性应答反应的NLR基因差异较大,这可能与不同NLR基因对不同病原特异性识别有关。

• 单位
  中国农业科学院蔬菜花卉研究所; 农业部