科研之友
微信
新浪微博
Facebook
分享链接
摘要
通过生物信息学研究细胞色素b561(Cytochromes b561, CYB561)与浸润性乳腺癌(Breast invasive carcinoma, BRCA)不良预后的相关性。CYB561氨基酸序列高度保守,在人体组织中广泛表达,可能预示着广泛的细胞功能。CYB561在多种癌症中的失调,提示其可能参与人类癌症发生发展进程。通过Oncomine和TIMER数据库发现,与相邻正常组织相比,CYB561表达在包括BRCA等多种癌症中差异表达。UALCAN数据库进行临床病理特征亚组分析表明,与正常人相比,不同种族和亚型的BRCA患者中CYB561的表达均上调。通过cBioPortal数据库发现CYB561基因组存在遗传变异,包括拷贝数扩增、融合和意义不明的错义突变。通过LinkedOmics和WebGestalt数据库分析CYB561和BRCA中差异表达的基因进行富集分析,可推测CYB561在BRCA中生物学功能。通过PrognoScan和GEPIA数据库分析CYB561的预后价值表明,高CYB561表达与BRCA不良预后显著相关。BRCA的预后存在着免疫细胞的参与,研究免疫细胞与CYB561表达之间的关系发现,免疫浸润的B细胞会影响预后,并且可能与BRCA中的CYB561有关。目前,对于CYB561研究较少,暂无CYB561关于BRCA的报道,我们通过不同的开放式数据库进行数据挖掘,研究了BRCA患者中CYB561表达和突变的数据,分析了其可能参与的生物学过程,并首次阐述了CYB561在BRCA中的失调且与不良预后相关。本研究为CYB561作为BRCA潜在的预后标志物提供了证据,揭示了CYB561的重要性,为进一步研究CYB561在BRCA中的作用奠定了基础,也为后续临床研究提供了参考。
-
单位湖北工业大学; 湖北省工业微生物重点实验室
