摘要

目的 探索基于DNA甲基化的中医概念量化表征方法。方法 采集集成抑郁症、轻度认知功能障碍、阿尔兹海默症、创伤后应激、焦虑障碍、产后抑郁症、骨质疏松、类风湿性关节炎、动脉硬化、脑卒中、乳腺癌、肠癌、肺癌等多种疾病的多组学数据,以及以中医术语注释的中药功效、药性、化学成分、靶标数据。提出了SEMO算法,计算干扰物与疾病表型的统计相关性。干扰物=药物/天然产物成分/营养素/中药/中医证候/中医治法。结果DAMOPA计算框架实现了基于DNA甲基化的中医证候、治法、方剂排序功能。在新冠重症预测、抑郁症、认知功能筛查、癌症预警等应用中,相比GO等本体论,中医证候标志物表型相关性更强,有因果涌现现象。开发的DNA甲基化捕获测序试剂盒,实现了基于唾液甲基化检测的中药复方计算(“甲基化开方”)、用证候甲基化标志物分析中药作用机制。结论 通过DNA甲基化数据可以量化表征中医概念,中医证候与现代医学通路分析可以在同一个计算框架内实现。