一种纤维素降解菌群的宏蛋白质组

作者：刘韪铭; 杨明; 李宪臻; 杨帆^*

来源：大连工业大学学报, 2022, 41(05): 319-325.

DOI：10.19670/j.cnki.dlgydxxb.2022.0502

• 纤维素
• 降解群落
• 宏蛋白质组学
• 液相色谱-串联质谱联用

应用液相色谱-串联质谱联用(LC-MS/MS)对一个能够降解纤维素的微生物群落FPDM在滤纸培养基中不同降解时间点的宏蛋白质组进行定性和定量分析，共检测到608种蛋白质，其中有40种为已注释纤维素酶，并观察到伴随纤维素降解过程的进行，纤维素酶的相对丰度变化与纤维素酶的功能相关。对宏蛋白质组的物种来源进行分析，表明群落FPDM主要由Sporocytophaga、Cohnella和Herbaspirillum组成，进一步分析发现分别是Sporocytophaga和Cohnella动态主导了纤维素在前中期与中后期的协同降解。通过短时间序列表达水平挖掘机(STEM)聚类分析的方法，预测了5种未被注释蛋白的功能，包含2种纤维素降解前中期相关蛋白与3种纤维素降解中后期相关蛋白。

• 单位
  大连工业大学; 生物工程学院