宁波市手足口病优势毒株肠道病毒A组71型VP1编码区基因进化分析

作者：高红; 顾文珍; 倪红霞; 谢蕾

来源：中国疫苗和免疫, 2015, 21(03): 278-288.

DOI：10.19914/j.cjvi.2015.03.009

• 手足口病
• 肠道病毒A组71型
• VP1编码区
• 基因亚型

目的研究浙江省宁波市手足口病(Hand,Foot and Mouth Disease;HFMD)优势毒株肠道病毒A组71型(Enterovirus Group A Type 71,EVA71)VP1编码区基因分子进化特征。方法收集宁波市20032010年HFMD患者标本,20032007年标本经过病毒分离后利用逆转录-聚合酶链反应(Reverse Transcription-Polymerase Chain Reaction,RT-PCR)对EV、EVA71和柯萨奇病毒A组16型(Coxsackie virus Group A Type 16,CVA16)进行检测;2008年标本利用RT-PCR直接进行检测;20092010年标本利用实时荧光(Real-time)RT-PCR直接进行检测,选择32例EVA71阳性标本进行VP1编码区基因扩增,扩增产物经过测序后利用序列分析软件(Lasergene)进行分析。结果宁波市20032010年共检测HFMD标本1335份,其中EV阳性1159份,总检出率为86.82%;EVA71阳性645份,占确证病例数的55.65%;CVA16阳性205份,占确证病例数的17.69%;未分型标本309份,占确证病例数的26.66%;未发现EVA71和CVA16同时阳性标本。32株代表株VP1编码区核苷酸序列的长度均为891碱基对(base pair,bp),编码297个氨基酸,核苷酸和氨基酸的同源性分别为95.2%100%和99.3%100%,与C4a基因亚型代表株的核苷酸和氨基酸的同源性最高,分别为95.4%99.2%和98%100%。氨基酸进化位点分析表明,来源于不同病例类型的毒株在氨基酸的组成上无明显差异。在基因进化树上,32株流行株全部处于C4a基因亚型分支上,但位于不同的进化簇中。结论 EVA71是引起宁波市20082010年HFMD的优势毒株,也是导致HFMD重症病例和死亡病例的主要病原。来源于不同病例类型的毒株在氨基酸的组成上无明显差异。32株代表株均属于C4a基因亚型,与同期我国其他地区流行株共同进化。

• 单位
  宁波市疾病预防控制中心