霍乱弧菌新发菌株中vipA,vipB和clpV对T6SS转录调控

作者：吴文轩; 郭扬; 张幸鼎^*; 赵文婧^*

来源：中山大学学报(医学科学版), 2022, 43(01): 77-85.

DOI：10.13471/j.cnki.j.sun.yat-sen.univ(med.sci).2022.0110

• 六型分泌系统
• 霍乱弧菌
• 转录调控

【目的】探索霍乱弧菌新发菌株H1的六型分泌系统(T6SS)存在的转录调控机制。【方法】本研究以转录组测序为基础，分析H1株分别由于vipA敲除(H1ΔvipA),vipB敲除(H1ΔvipB)和clpV敲除(H1ΔclpV)时T6SS基因簇的转录水平，并对其差异基因进行了基因本体论(GO)富集和京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集。【结果】发现H1ΔvipA有22个差异基因(FDR<0.01，|log2FC|≥1)，其中有18个属于T6SS基因簇；并且除vipA外，其转录水平均呈上升趋势。结合GO富集和KEGG富集结果，发现vipA的缺失会引起与霍乱弧菌群体感应相关基因(hapR)的转录水平显著降低。【结论】我们得出结论 vipA基因在霍乱弧菌H1菌中是一个具有多重功能的基因，一是编码T6SS鞘结构蛋白，二是参与T6SS调控；推测hapR可能参与H1株中vipA对T6SS基因簇的转录调控。

• 单位
  中山大学