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摘要
目的通过与人类全基因组寡核苷酸微阵列杂交及分析,筛查季节性变应性鼻炎(seasonal allergic rhinitis,SAR)与 SAR 合并哮喘患者鼻黏膜的差异基因表达谱。方法分别取5例SAR 及4例 SAR 合并哮喘患者的下鼻甲黏膜,提取总 RNA,合成生物素标记的 cRNA 探针,与美国Affymetrix 公司人类全基因组寡核苷酸微阵列 HG-U133-plus2杂交,并以反转录聚合酶链反应(reversetranscription polymerse chian reaction,RT-PCR)验证芯片结果。采用 GeneSpring7.3软件分析基因表达数据,对差异基因进行基因本体论分类和生物通路注释。结果在38 500多个基因(47 000个转录本)中,SAR 合并哮喘者,其鼻黏膜发生2倍以上差异表达的基因共有1 900个,其中849个基因表达上调,1 051个表达下调。这些基因功能主要与细胞代谢、基因转录、细胞增殖、信号转导、免疫应答、多种酶活性、膜受体结合活性、细胞结构蛋白活性等有关。生物通路分成161类,其中包含20个基因以上的通路有:细胞因子受体间相互作用,局部黏附,细胞黏附分子,细胞骨架肌动蛋白调节,细胞间信号传递,缝隙连接,促分裂原活化蛋白激酶信号传导通路,钙相关信号传导通路,白细胞跨膜转运以及嘌呤代谢等生物通路。结论 SAR 及 SAR 合并哮喘存在多基因表达调控的改变,对其差异表达基因的研究有助于阐明变应性鼻炎及其合并哮喘的发生发展机制。
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