菜用大豆蔗糖转运蛋白生物信息学分析

作者：张玉梅; 胡润芳; 林国强^*

来源：大豆科学, 2018, 37(06): 866-870.

• 菜用大豆
• 蔗糖转运蛋白
• 生物信息学分析
• GmSUT基因

为揭示菜用大豆SUT基因的结构特点,并为提高其表达活性提供理论依据,利用RT-PCR技术克隆菜用大豆SUT基因,长度为1 634 bp,编码区1 566 bp,编码一个含有521个氨基酸残基的多肽。生物信息学分析表明,SUT理论等电点9. 33,理论分子量55. 19 kD,是疏水性蛋白。SOMPA分析表明,SUT各个氨基酸残基对应的二级结构为α螺旋45. 11%、β折叠14. 20%、无规则卷曲36. 47%和β转角4. 22%;氨基酸序列和结构分析显示SUT蛋白包含1个保守区,即MFS2 domain和12个跨膜区。Signal P分析表明该蛋白没有信号肽。系统进化树分析表明菜用大豆GmSUT蛋白与绿豆(Vignaradiata var. radiata)的亲缘关系最近,同源性达93. 28%。将该蛋白与拟南芥的9个SUC蛋白比对表明GmSUT与At SUC2的亲缘关系最近,属于SUT1亚族。

• 单位
  福建省农业科学院