生物信息学及实验验证S100A8为溃疡性结肠炎致炎基因

作者：杨强; 赵旦娅; 钦丹萍^*

来源：中国免疫学杂志, 2023, 1-11.

• 溃疡性结肠炎
• 生物信息学分析
• S100A8
• 致炎
• 分子对接

背景：溃疡性结肠炎是一种慢性炎症性肠病，激活多条炎症通路，但是关于诱导炎症的致炎因子仍不明确。方法：从GEO中纳入三组人类基因芯片数据集，使用R软件分析其中两组数据集中的差异表达基因（DEGs），并结合研究前期的UC大鼠基因芯片的前20个DEGs，取交集后筛选出UC的核心基因。随后在另一个人类芯片数据集中利用ROC曲线评估核心基因的敏感性和特异性，采用CIBERSORT分析核心基因与免疫细胞的关系，使用蛋白质-蛋白质相互作用网络图识别与核心基因共表达的蛋白质并进行功能富集分析，将核心基因与治疗UC的抗炎中药进行分子对接，最后通过体外实验验证核心基因与炎症的相关性以及抗炎中药对核心基因的作用。结果：S100A8是溃疡性结肠炎的核心基因，具有高敏感性和特异性(AUC=0.953)，S100A8与中性粒细胞、活化的肥大细胞和单核细胞等免疫炎性细胞呈正相关，PPI及功能富集分析发现S100A8与RAS信号通路、PI3K-AKT信号通路、mTOR信号通路等炎症通路相关，抗炎中药雷公藤红素、黄芩苷、小檗碱与S100A8均有较好的结合力，体外实验提示S100A8在炎症中发挥重要作用，雷公藤红素、黄芩苷、小檗碱均能降低S100A8表达。结论：S100A8可能是UC的致炎核心基因，有望成为新的治疗靶点。

• 单位
  浙江中医药大学; 第一临床医学院