野蔷薇MATE基因的生物信息学分析

作者：陈锐; 徐瑶; 冯条红; 徐睆; 程文翰

来源：分子植物育种, 2022, 1-14.

• 野蔷薇
• MATE基因家族
• 生物信息学

多药物及有毒复合物外排蛋白家族(multidrug and toxic compound extrusion family， MATE)可转运阳离子染料、氨基葡糖、多种抗生素与药物等次生代谢产物。利用模式生物拟南芥(Arabidopsis thaliana)的MATE家族蛋白的氨基酸序列与ROSA的数据库进行比对，得到3条野蔷薇(Rosa multiflora Thunb.) MATE基因序列，命名为RmMATE1、RmMATE2和RmMATE。利用利用生信数据库对这三条序列的蛋白结构域、亚细胞定位、物理特性、跨膜结构等进行了分析，并分析了拟南芥AtMATE基因的表达模式，推测了RmMATE的表达模式。为深入探索野蔷薇MATE家族基因的结构和功能及其作用机制提供了有价值的资料。

• 单位
  荆楚理工学院; 生物工程学院