摘要
柠条锦鸡儿(Caragana korshinskii)是西北干旱地区的重要固沙灌木,具有耐旱、耐寒、耐盐碱的特性。研究其优良抗逆境基因,可以作为林草基因工程的基因源。DIR蛋白广泛存在于多种物种中,主要参与木脂素和木质素的形成以及植物对非生物和生物胁迫抗性的增加。本研究对CkDIR基因进行相关生物信息学分析,并将ORF序列进行克隆进一步构建了表达载体并筛选了纯合体株系;并将该基因在转录组中进行亲缘关系分析,对该基因的功能进行了初步的探索。结果表明,CkDIR基因为柠条锦鸡儿中包含典型DIR结构域的一个基因,属于DIR-a亚家族;该基因ORF长561 bp,编码了一个由186个氨基酸组成的疏水性蛋白。通过比对分析发现该基因与大豆PDH1基因同源,具有较近的亲缘关系,这表明CkDIR基因可能在荚果开裂过程中起作用;对转录组中亲缘关系最高的基因进行功能注释分析表明,CkDIR可能在植物抗病或细胞组分构成当中起作用。本研究初步阐明CkDIR基因的序列特征及功能,为后续深入研究CkDIR基因的功能及作用机理提供了基础。
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