3岁高龋与无龋儿童龈上菌斑微生物差异的宏基因组学分析

作者：张倩霞; 郭静; 关玲霞; 传爱云; 张薇; 李玉姣; 王胜朝^*

来源：中国实用口腔科杂志, 2020, 13(10): 604-610.

DOI：10.19538/j.kq.2020.10.007

• 儿童
• 龋病
• 龈上菌斑
• 16S rDNA测序
• 口腔微生态
• 宏基因组学

目的用16S rDNA测序技术,探讨不同龋患程度儿童乳牙龈上菌斑微生物多样性及差异。方法选择3岁龄儿童为研究对象,高龋组(dmft≥5)和无龋组(dmft=0)各12名,采集光滑面龈上菌斑,基于Ion S5TMXL平台(Thermo Fisher,美国)进行16S V4区域测序并对比分析。结果通过与SILVA132数据库比对,可注释到14个菌门、21个菌纲、53个菌目、93个菌科、150个菌属、159个菌种。Alpha多样性分析提示高龋组物种丰富度和均匀度低于无龋组。Beta多样性分析显示高龋和无龋样本群落结构相似,组间无显著分离。两组中,优势菌门为放线菌门、变形菌门、厚壁菌门、拟杆菌门、梭杆菌门等;优势菌属为放线菌属、棒状杆菌属、奈瑟菌属、罗氏菌属、链球菌属、二氧化碳嗜纤维菌属等。LEfSe分析显示,高龋组显著丰富的微生物菌群有罗氏菌属、嗜血杆菌属、金氏菌属、龋齿罗氏菌、奈瑟杆菌等(P <0.05);无龋组显著丰富的微生物菌群有梭杆菌门、纤毛菌属、LeptotrichiasporalcloneIK040、颗粒二氧化碳嗜纤维菌等(P <0.05)。变形链球菌的相对丰度在两组之间不存在显著差异(P> 0.05)。远缘链球菌仅在高龋组中被检出。此外,两组微生物样本中均存在低丰度的未曾定义新物种。PICRUSt分析显示,高龋组的微生物物质代谢与能量代谢等较无龋组更为丰富。结论 3岁儿童乳牙龈上菌斑微生物群落呈现多样性,不同龋患程度儿童口腔微生物群落在不同分类和功能水平上呈现显著差异,为乳牙龋的微生物因素研究提供了新数据。

• 单位
  第四军医大学; 军事口腔医学国家重点实验室