基于分子对接和网络药理学探寻中、蒙药抗新型冠状病毒感染的有效成分

作者:朱小玲; 孙国园; 李斌鑫; 贾鑫; 董玉; 刘天龙*
来源:内蒙古大学学报(自然科学版), 2023, 54(02): 179-190.
DOI:10.13484/j.nmgdxxbzk.20230208

摘要

本研究旨在探索治疗新型冠状病毒感染的有效成分及潜在作用机制。通过查阅文献,寻找蒙医治疗粘疫病、中医治疗疫病的常用药材,并借助TCMSP、Batman等数据库检索所选药材的化学成分,选取OB≥30%,DL≥0.18的化学成分,再与血管紧张素转化酶Ⅱ(ACE2)进行分子对接计算,选择出结合能小于洛匹那韦的化学成分。通过Swiss Target Prediction,检索出所选化学成分的作用靶点。通过TTD、Drugbank、DisGeNET,筛选出新型冠状病毒感染不同感染阶段的疾病靶点。使用Cytoscape3.7.2软件构建“成分-靶点”网络和蛋白质-蛋白质相互作用网络,通过GO富集分析和KEGG通路分析,探究有效成分治疗新型冠状病毒感染的作用机制。分子对接和网络药理学结果显示,四氢小檗碱、半甘草异黄酮等成分与ACE2有较好的结合能力,并可通过多靶点、多通路发挥抗新冠病毒作用。黄连、甘草等14味药材可能对治疗新型冠状病毒感染有效。

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