乙型肝炎病毒Y(I/V)DD变异与前C及C基因启动子变异生物信息研究

作者:阎丽; 王介飞; 王战会; 孙剑; 周彬; 侯金林
来源:中华肝脏病杂志, 2014, 22(12): 891-894.
DOI:10.3760/cma.j.issn.1007-3418.2014.12.003

摘要

目的分析HBV反转录酶区(RT)rtM204位点Y(I/V)DD变异与前C及C基因启动子(PC-BCP)变异关系。方法应用MEGA4对来自GenBank/EMBL/DDBJ的人类2 849株HBV全基因序列序列重新排列,分析Y(I/V)DD变异与PC-BCP变异及模式相关性。结果 rtM204(I/V)DD变异株217株(8.0%);PC-BCP变异株1 543株(54.2%),有(1)G1896A、(2)G1899A、(3)G1896A+G1899A、(4)A1762T/G1764A、(5)A1762T/G1764A+G1896A、(6)A1762T/G1764A+G1899A、(7)A1762T/G1764A+G1896A+G1899A 7种变异模式;Y(I/V)DD与PC-BCP联合变异165株。YMDD与PC-BCP双变异率高于单纯YMDD变异率(76%比24.0%,x2=45.283,P=0.000);YIDD与PC-BCP双变异率高于YVDD与PC-BCP双变异率(85%比64.9%,x2=11.836,P=0.000)及使用LAM致YMDD与PC-BCP双变异率高于未使用LAM预存YMDD与PC-BCP双变异率(89.3%比58.9%,x2=27.084,P=0.000)。二分类logistic回归分析仅对YIDD有影响而对YVDD无影响的PC-BCP变异模式有G1896A-G1899A(P=0.000,OR=7.573)、A1762T/G1764A-G1899A(P=0.000,OR=6.539)和A1762T/G1764A-G1896AG1899A(P=0.000,OR=6.596)。结论 YMDD变异与PC-BCP变异相关;PC-BCP变异模式的差异与YI/VDD变异选择强度有一定的关系。

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