瘟疫是新疆多种自然灾害之一,本文根据满汉文档案记载,梳理了清代新疆瘟疫的时空分布,认为伊犁地区是新疆瘟疫多发区和重灾区。在清廷的统筹下,形成了以地方官府为主导的救灾防灾应对举措。清代新疆地区瘟疫防治提升了新疆地区公共医疗水平,增强了人们应对、抵御自然灾害的能力。