上海市某腹泻猪群猪流行性腹泻病毒检测及全基因序列分析

作者：康龙山; 于慧茹; 杨德全; 李鑫; 沈海潇; 杨显超; 王建; 徐丽娜; 葛菲菲

来源：中国动物传染病学报, 2022, 1-8.

DOI：10.19958/j.cnki.cn31-2031/s.20220221.007

• 猪流行性腹泻病毒
• 系统进化
• S基因

猪流行性腹泻（PED）是由猪流行性腹泻病毒（PEDV）感染引起的仔猪严重腹泻性疾病，传播快，发病急、死亡率高，给我国养猪业造成巨大损失。2021年10月上海一猪场产房仔猪发生腹泻，发病率为30%-50%，死亡率为20%-30%，猪群之前进行过疫苗免疫。粪便样本经猪流行性腹泻病毒、猪传染性胃肠炎病毒(TGEV)、猪轮状病毒(RV)荧光RT-PCR检测，结果显示：PEDV检测为阳性，TGEV和RV检测均为阴性。经全基因测序后进行系统进化分析，结果显示：全基因序列属于GII-c亚群，S基因序列属于GII-b亚群，与目前的经典疫苗株CV777和变异株AJ1102相比，CV777的全基因和S基因都属于GI-b群，AJ1102的全基因和S基因都属于GII-b亚群，研究结果表明新基因型的PEDV已在上海地区流行，而传统疫苗株无法提供好的免疫效果，提示新的防控策略的制定和有针对性的疫苗的生产和使用，对于预防PEDV感染和流行有重要意义。

• 单位
  上海市动物疫病预防控制中心; 生命科学与食品工程学院; 河北工程大学