丝瓜WRKY基因家族鉴定与表达分析

作者：陈珂; 王成; 王勃; 尉万聪; 兰青阔; 王莅; 仝雅娜; 王俊杰; 张桂霞^*; 王永^*

来源：分子植物育种, 2023, 1-24.

• 丝瓜
• WRKY
• 全基因组鉴定
• 温度胁迫

本研究利用生物信息学技术，在丝瓜基因组中共鉴定出57个LcWRKY基因，命名为LcWRKY1～LcWRKY57，分布在13条scaffolds上。系统进化树表明，LcWRKYs可分为Ⅰ组、Ⅱ组和Ⅲ组，其中Ⅱ组可进一步分为5个亚组。所有LcWRKYs均具有高度保守的WRKYGQK基序及其特有的锌指结构，同一组或亚组的WRKY成员在基因结构和保守基序上表现出一定的相似性。通过启动子顺式作用元件分析，LcWRKYs包含多个与激素、胁迫以及生长发育相关的元件。在低温胁迫下，LcWRKY34表达量上调；高温胁迫下，LcWRKY54持续高表达。本研究从全基因组水平上鉴定和分析了丝瓜WRKY基因家族，为深入研究LcWRKY及温度胁迫下的功能研究提供参考依据。

• 单位
  天津市农业科学院; 天津农学院