基于数据挖掘的PFKFB4在宫颈癌中的表达和基因调控网络研究

作者：古彩茹; 刘威; 林梦园^*

来源：海南医学, 2022, 33(02): 137-142.

DOI：10.3969/j.issn.1003-6350.2022.02.001

• 6-磷酸果糖-2-激酶/果糖-2,6-二磷酸酶4
• 宫颈癌
• 生物信息学
• 诊断
• 预后

目的研究6-磷酸果糖-2-激酶/果糖-2,6-二磷酸酶4 (PFKFB4)的表达水平与宫颈癌患者临床病理特征和预后的关系,并探讨PFKFB4在宫颈癌进展中的调控网络。方法利用Linked Omics数据平台分析PFKFB4的表达与宫颈癌患者临床病理特征及预后的关系。利用Linked Omics的Link Finder模块Gene Set Enrichment Analysis (GSEA)对差异相关基因进行基因本体(GO)[细胞成分(CC),生物过程(BP)和分子功能(MF)]分析。KEGG信号通路分析激酶靶标富集,miRNA靶标富集和转录因子靶标富集。cBioPortal用于分析PFKFB4在宫颈癌中的变异频率和类型。Gene MANIA用于分析与PFKFB4存在相互作用的基因以及主要涉及的功能。结果 PFKFB4与宫颈癌的T分期、N分期和M分期显著相关;T分期越高、有淋巴结转移(N1)、伴有远处转移(M1)者PFKFB4表达量越高;PFKFB4高表达患者的总生存显著差于低表达患者(P=0.002);GO分析提示PFKFB4相关基因与蛋白结合、离子结合、核酸结合、水解酶活动、转移酶活动等相关;KEGG信号通路富集分析则发现,PFKFB4及相关基因在宫颈癌中主要参与了缺氧诱导因子HIF1信号通路、糖酵解/糖再生信号通路、果糖和甘露糖代谢通路等;GSEA分析显示,MK2PK1、CHEK1、miR-200a、miR-18a、HIF1、AP1与PFKFB4的表达显著相关;cBioPortal分析显示,PFKFB4在宫颈癌中主要变异形式为m RNA高表达,但是突变频率较低。结论 PFKFB4是宫颈癌一个潜在的预后标记物。通过数据挖掘揭示了PFKFB4的潜在调控网络信息,为进一步研究PFKFB4在宫颈癌中的作用奠定基础。

• 单位
  暨南大学附属广州红十字会医院; 深圳市人民医院; 广州市红十字会医院