不同发育时期蓝果忍冬果实的转录组分析

作者:孙燕; 王金刚*; 臧丹丹*; 赵恒田; 刘淑华
来源:生物技术通报, 2022, 38(12): 204-213.
DOI:10.13560/j.cnki.biotech.bull.1985.2022-0330

摘要

为研究不同发育时期(绿熟期和成熟期)蓝果忍冬果实基因的表达差异,探索蓝果忍冬在生长发育过程中的关键代谢通路,以‘中科蓝1号’蓝果忍冬品种为研究对象,利用高通量测序技术对蓝果忍冬绿熟期和成熟期果实的转录组数据进行比较分析。结果表明,共有40.32 Gb Clean Data,每个样品Clean Data均大于6.07 Gb,Q30碱基百分比均在93.89%及以上,GC含量为46.32%-49.38%;两个发育时期的果实共检测出3 247个差异表达基因,包括1 642个上调基因和1 605个下调基因;GO功能富集分析发现,蓝果忍冬果实发育过程中的关键调控基因主要参与代谢、细胞和细胞组分以及催化过程;KEGG富集分析发现,差异表达基因主要富集在植物激素信号转导、碳代谢和氨基酸生物合成等途径。该结果为进一步研究蓝果忍冬果实发育过程中的动态变化提供了参考,为后续开展蓝果忍冬功能基因鉴定、遗传多样性分析等研究提供理论依据。

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