肾透明细胞癌铁死亡相关亚型的分析与预后列线图的建立

作者：闫旭韬; 张彦隆; 闫鹏宇; 李佳伟; 杨晓峰^*

来源：国际泌尿系统杂志, 2023, 43(05).

• 癌, 肾细胞
• 铁死亡
• 列线图

目的利用生物信息学方法对肾透明细胞癌(ccRCC)患者进行铁死亡相关亚型分析, 筛选与预后显著相关的铁死亡相关基因, 并建立列线图。方法在癌症基因组图谱(TCGA)数据库中下载具有临床数据的526例ccRCC和72例癌旁正常组织的转录组数据及临床数据, 数据提取时间为建库起至2020年11月5日。采用围绕中心点划分(PAM)算法确定亚型数量。采用基因本体数据库(GO)功能富集分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)功能富集分析探索潜在功能与通路。采用单因素Cox、Kaplan-Meier生存曲线分析及最小绝对值收敛和选择算子(Lasso)回归分析和多因素Cox分析筛选ccRCC铁死亡相关基因, 并建立列线图。结果共确定了4种ccRCC铁死亡相关亚型, 分别为cluster1～4。富集分析发现亚型特征基因与细胞免疫、肿瘤微环境密切相关。筛选得到了10个ccRCC铁死亡相关基因(HMOX1、MT1G、CHAC1、LURAP1L、CXCL2、RRM2、TRIB3、DUSP1、GABARAPL1、ALOX12B)。建立了包含年龄、M分期、病理分期、组织分级和风险评分的列线图, 列线图的1、3、5年的受试者工作特征(ROC)曲线下面积分别为0.858、0.809、0.774。结论确定4种ccRCC铁死亡相关亚型, 亚型分型与患者临床预后相关。研究所建立的列线图对ccRCC患者预后有较好的预测能力, 模型的ccRCC铁死亡相关基因可作为研究ccRCC发病机制和靶向治疗的靶点。

• 单位
  山西医科大学第一医院