巨噬细胞与单核细胞的细胞骨架调控相关的差异基因表达

作者：宋咏刚; 胡文慧; 余鹏; 石玉玲; 赵雪; 胡祖权; 王赟; 曾柱^*

来源：贵州医科大学学报, 2019, 44(12): 1383-1389.

DOI：10.19367/j.cnki.1000-2707.2019.12.004

• 巨噬细胞
• 单核细胞
• 细胞骨架
• 生物信息学
• 基因芯片

目的:分析单核细胞(Mo)向巨噬细胞(Mφ)分化的过程中,细胞骨架的调控相关基因及信号通路的表达变化。方法:CEO数据库获得Mo和Mφ的芯片数据,经RStudio软件分析获得差异表达基因(DEGenes),利用STRING在线工具对DEGenes构建蛋白质相互作用网络(PPI),Cytoscap软件筛选出DEGenes的核心模块;对筛选出的DEGenes的核心模块进行GO和KEGG分析。结果:Mφ相对于Mo的差异表达基因共476个,主要涉及的信号通路包括NOD样受体信号通路和吞噬体信号通路,这些通路中CCL18、CXCL8和C3等相关基因与细胞骨架的调控密切相关。结论:Mo向Mφ分化过程中细胞骨架调控相关基因的表达发生了显著改变。

• 单位
  基础医学院; 贵州医科大学