还原叶酸载体(RFC1)在结直肠中的表达、相关信号通路及其与患者预后关系的生物信息学分析

作者：张静会; 闫瑞振; 魏志斌; 王宝占^*

来源：国际生物医学工程杂志, 2022, 45(02).

• 结直肠癌
• 还原叶酸载体
• 生物信息
• 预后分析

目的探讨还原叶酸载体(RFC1)在结直肠癌(CRC)中的表达、相关信号通路及其与患者预后关系。方法在癌症基因组图集(TCGA)数据库中分析RFC1基因在多种实体肿瘤及CRC中的表达情况。采用检索相互作用基因的搜索工具(STRING)建立RFC1蛋白相互作用网络。通过使用基因表达谱交互分析(GEPIA)数据库比较RFC1高、低表达组患者的生存期差异。使用注释、可视化和集成发现(DAVID)数据库对差异表达基因进行基因肿瘤学(GO)和京都基因和基因组百科全书(KEGG)富集分析。分析CRC组织和癌旁正常组织中RFC1的免疫组化表达水平及其表达部位。结果 RFC1 mRNA在各种人类实体肿瘤中的表达差异并不明显。在CRC组织中, RFC1表达水平高于癌旁正常组织, 但RFC1表达水平与患者的肿瘤分期无关。RFC1蛋白间的相互联系指数为119, 平均蛋白间区域聚类系数为0.836, RFC1及其相互作用基因间存在明显的蛋白网络富集(P<0.05)。RFC1生物学过程主要富集于DNA复制、半保守复制维持端粒活性、DNA代谢过程、无差错翻译合成、参与DNA修复的DNA合成等;细胞成分主要富集于复制叉、染色体、核质、DNA复制因子C复合物、Ctf18类RFC复合物等;分子功能主要富集于DNA结合核酸结合、DNA结合受损、DNA活性、催化活性等。对于KEGG信号通路, RFC1主要富集于DNA复制、核苷酸切除修复、错配修复和恶性肿瘤发生等。RFC1高表达者的无病生存率和总生存率低于低表达组, 其中两者在总生存率上的差异有统计学意义(P<0.05)。RFC1蛋白主要表达于细胞质, 阳性表达呈现黄褐色颗粒状, 均匀分布于细胞内, 且在结直肠癌组织中RFC1大多为高或中表达, 而在正常肠上皮中低表达。结论 RFC1在CRC组织中表达升高, 其高表达与CRC患者的总生存率降低有关。RFC1可作为CRC预后不良的分子标志物, 并可能成为CRC治疗的潜在靶点。

• 单位
  天津市宝坻区人民医院