5XFAD转基因小鼠的肠道菌群变化分析

作者：罗志宇; 楚兴坤; 常帅帅; 冯园; 杨大兵; 王薪懿; 杜晓光; 冯腾; 张靖^*

来源：阿尔茨海默病及相关病杂志, 2021, 4(03): 179-184.

• 肠道菌群
• 16S rRNA高通量测序
• 5XFAD

目的:探究5XFAD阿尔茨海默病(AD)转基因小鼠相比野生型(WT)小鼠的肠道菌群变化以及性别因素的影响。方法:采集不同性别5XFAD小鼠和WT小鼠的粪便,使用高通量测序方法对粪便基因组DNA进行16S rRNA测序。再通过nf-core和基于R语言平台的生信分析手段对测序数据进行差异分析和功能预测。结果:与WT小鼠相比,在菌群构成的门水平上,5XFAD转基因小鼠的ε-变形菌门(Epsilonbacteraeota)和变形菌门(Proteobacteria)丰富度普遍较低。在属水平上,5XFAD转基因小鼠的另枝菌属(Alistipes)和乳杆菌属(Lactobacillus)丰富度明显偏高,螺杆菌属(Helicobacter)的丰富度偏低。5XFAD小鼠与WT小鼠的菌群功能也存在差异。此外,菌群的结构和功能在不同性别小鼠中也显示出差异。结论:5XFAD转基因小鼠的肠道菌群与WT小鼠存在结构和功能差异,且这种差异受性别因素影响。