星形胶质细胞外显子组中A-to-I RNA编辑位点的高通量测序鉴定

作者：王海涛; 周海红; 闵建平; 王涛; 王兰; 郭欢; 张永东; 苏海翔^*

来源：甘肃医药, 2020, 39(08): 673-677.

DOI：10.15975/j.cnki.gsyy.2020.08.001

• 星形胶质细胞
• 外显子组
• A-to-I RNA编辑
• 高通量测序

目的:采用高通量测序技术鉴定星形胶质细胞外显子组中A至I RNA编辑。方法:对4个星形胶质细胞样本的转录组和外显子组分别进行高通量测序,利用生物信息学方法进行深度分析,鉴定出星形胶质细胞外显子组中A至I RNA编辑位点。结果:在星形胶质细胞外显子组中共鉴定出1751个A至I RNA编辑位点,其中5’UTR有110个,3’UTR有1390个,编码区有251个,包括118个错义A至I RNA编辑位点。结论:本研究完成了星形胶质细胞外显子组中A至I RNA编辑位点的鉴定,研究结果将有助于深入理解A至I RNA编辑在神经系统疾病发生中的作用机制。

• 单位
  甘肃省医学科学研究院