大戟科Lhcb基因家族的全基因组鉴定、分类与进化分析

作者：邹智; 安锋; 杨礼富; 王真辉; 袁坤

来源：中南林业科技大学学报, 2013, (12): 46-52.

DOI：10.14067/j.cnki.1673-923x.2013.12.023

• 大戟科植物
• 全基因组
• Lhcb基因家族
• 鉴定
• 分类
• 进化分析 Euphorbiaceae plant
• genome-wide
• Lhcb gene family
• identification
• classification
• phylogenetic analysis

基于已公布的基因组和EST数据,研究对蓖麻、麻疯树、木薯和橡胶树4种大戟科植物的Lhcb基因家族进行系统鉴定,并在此基础上分析其基因结构与进化关系。结果表明,蓖麻、麻疯树、木薯和橡胶树分别含有10、10、13和15个Lhcb基因,分属于Lhcb1、Lhcb2、Lhcb3、Lhcb4、Lhcb5、Lhcb6、Lhcb7和Lhcb8等8个亚家族,每个亚家族包含1～4个成员不等,基因的内含子数目在0～5个之间,部分基因还存在可变剪接形式。进化分析显示,Lhcb1、Lhcb4、Lhcb5和Lhcb7亚族早于单细胞的藻类中就已产生,Lhcb3和Lhcb6亚族在光合生物向陆地进化后产生,Lhcb2亚族存在...

• 单位
  农业部; 中国热带农业科学院橡胶研究所