生物信息学分析慢性阻塞性肺疾病在肺癌中的影响

作者：孟恒; 宋从宽; 李宁; 江万里; 耿庆^*

来源：中华实验外科杂志, 2022, 39(06).

• 慢性阻塞性肺疾病
• 非小细胞肺癌
• 生物信息学

目的基于生物信息学分析慢性阻塞性肺疾病(COPD)状态对非小细胞肺癌(NSCLC)的影响, 以期揭示COPD状态对非小细胞肺癌的影响。方法从癌症基因组图谱数据库中下载161例肺癌患者的相关信息并根据病理类型与肺功能结果进行分组。在同一病理下, 比较有无COPD的两组的差异。京都基因与基因组百科全书(KEGG)和基因本体论(GO)分析用于功能富集分析, 进行加权共表达网络分析(WGCNA)并构建蛋白互作网络(PPI)筛选核心枢纽基因。所有计量资料组间比较采用t检验, 计数资料组间比较采用χ2检验。结果本研究纳入了161例肺癌患者的样本数据。有、无COPD在临床特征、体细胞基因突变频率以及免疫细胞浸润上差异无统计学意义(P>0.05)。在鳞癌及腺癌中, COPD组别中大量代谢有关通路上调, 而细胞趋化能力的调节等通路下调。后续WGCNA及PPI分析鉴定出钠离子通道α2亚基(SCN2A)、富酪蛋白(STATH)、细胞色素P450家族成员(CYP1A2及CYP1B1)、γ-氨基丁酸A型受体亚基(GABRA1)紧密连接蛋白17 (CLDN17)、调节突触膜胞吐蛋白1 (RIMS1)、维生素D结合蛋白(GC)以及血浆铜蓝蛋白(CP)可能是潜在枢纽基因。只有在腺癌中, COPD组的患者年龄组成比率上[<60岁:80.8%(21/26);>60岁:19.2%(5/26)]相比无COPD组[<60岁:56.1%(32/57);>60岁:43.9%(25/57)], 结果差异有统计学意义(χ2=4.693, P<0.05)。结论 COPD状态对肺癌的预后, 体细胞突变等无贡献, 并提出9个潜在的COPD型肺癌关键枢纽基因。

• 单位
  武汉大学人民医院