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摘要
目的:通过生物信息学的方法探究糖尿病视网膜病变(DR)中免疫相关的关键基因以及免疫细胞的浸润情况。方法:2022-09/10从GEO数据库获取基因芯片数据集，采用“limma”R包获得差异表达基因(DEGs),并进行GO功能注释和KEGG通路富集分析，基于CIBERSORT算法分析免疫细胞浸润情况。通过加权基因共表达网络分析(WGCNA)筛选与免疫相关基因模块中的DEGs,利用STRING在线数据库及Cytoscape软件构建蛋白质互作网络，利用MCODE以及cytoHubba插件进一步并筛选出关键基因。结果:共筛选出上调差异基因1 426个，下调差异基因206个。原始B细胞、血浆细胞、记忆型CD4+T细胞、调节性T细胞(Tregs)、M0型巨噬细胞、M1型巨噬细胞以及中性粒细胞7种免疫细胞显著高表达(P<0.05);NK cells activated这种免疫细胞低表达(P<0.05)。WGCNA分析后，与免疫最相关模块中差异基因820个，构建PPI网络后利用插件筛选出10个关键基因，利用各差异基因在PPI中的相关性程度进一步筛选出2个关键基因为DLGAP5与AURKB。结论:利用生物信息学的方式筛选出DR患者中免疫细胞浸润情况以及与免疫相关的关键基因，可为DR的进一步研究与诊疗提供依据。
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单位大连市第三人民医院; 大连医科大学
