4株猪流行性腹泻病毒S1基因生物信息学分析

作者：朱海侠

来源：中国畜牧兽医, 2016, 43(11): 3024-3030.

DOI：10.16431/j.cnki.1671-7236.2016.11.032

• 猪流行性腹泻病毒
• 遗传进化
• B细胞抗原表位

为分析猪流行性腹泻病毒(porcine epidemic diarrhea virus,PEDV)的遗传变异情况,本研究设计合成1对引物,应用RT-PCR方法扩增S1基因的主要中和表位区序列,并对4株PEDV分离株S1基因中和表位区进行遗传进化和B细胞抗原表位分析。结果显示,4株分离株位于同一进化分支G2上,其中湖南株和河南株与JXGZ2013、GDZQ2012、GDZQ2014株亲缘关系最近,同源性高达98.3%98.7%;上海株与BJ-2011株、LZW分离株核苷酸同源性高达98.7%左右;福建株与2013年美国株、日本株及中国台湾变异株亲缘关系较近,核苷酸同源性高达99.0%99.5%;B细胞线性抗原分析显示,与疫苗株相比,4株流行株在265-278位氨基酸处抗原表位明显增强。提示近年来PEDV呈现快速变异和进化趋势,抗原表位的变化可能是影响PEDV流行株感染性的主要原因。

• 单位
  福州大北农生物技术有限公司