柯萨奇病毒A组16型河南省分离株基因组序列分析

作者：黄学勇; 许玉玲; 卫海燕; 武景福; 康锴; 王彦霞; 陈豪敏; 许汴利

来源：病毒学报, 2012, (02): 118-123.

DOI：10.13242/j.cnki.bingduxuebao.002253

• CoxAl6病毒
• 基因组
• 序列
• 遗传发育 Coxsackievirus A16
• Genome
• Sequences
• Phylogenetic tree

为了解河南省手足口病患者标本中分离柯萨奇A组的16型(CoxAl6)病毒基因组特征,对2010年采集的手足口病患者临床标本406份进行RT-PCR扩增和病毒分离鉴定;通过10对引物分段扩增和拼接CoxAl6分离株基因组序列,利用生物信息学软件对序列分析,构建序列遗传发育树。测序获得河南省CoxAl6分离株HN1162/HN/CHN/2010基因组全长序列7 411bp,5′非编码区(5′UTR)、P1、P2、P3、3′非编码区(3′UTR)区域核苷酸序列与GenBank公布的其它分离株相似性分别为87.0%～97.9%、77.0%～95.4%、80.3%～96.9%、77.9%～96.2%、8...

• 单位
  河南省疾病预防控制中心; 三门峡市疾病预防控制中心