不同日龄仔猪肠道菌群的组成与差异

作者：刘丹; 孟江海; 曹斌; 李灿; 曾维; 纪春晓; 陈韬^*

来源：动物医学进展, 2023, 44(02): 78-83.

DOI：10.16437/j.cnki.1007-5038.2023.02.008

• 仔猪
• 肠道菌群
• 16S rRNA基因测序
• 差异分析

为确定新生仔猪肠道菌群组成以及新生仔猪不同发育阶段肠道菌群的分布和变化，并探讨仔猪肠道不同发育阶段各个优势菌群的功能，找到仔猪肠道菌群的演变规律。试验选取不同日龄(0、5、10、15、20、25、30 d)健康二元仔猪，收集其结肠内容物，用16S rRNA基因高通量测序方法，分析不同日龄仔猪肠道菌群的菌群分布和变化。通过Alpha多样性分析显示，不同日龄仔猪肠道菌群存在多样性差异，其0 d～20 d的多样性呈现下降趋势，而20 d～30 d的多样性呈现上升趋势；在门水平，肠道菌群主要由Firmicutes(43.5%)、Bacteroidota(26.9%)两个门组成，占比为70.4%。不同日龄仔猪的Firmicutes和Bacteroidota变化趋势各不相同；在属水平，不同生长阶段的优势菌属各不同，断奶前仔猪Lactobacillus、Bacteroidota等与碳水化合物等营养物质代谢相关的菌属丰度较高；断奶后Prevotella、Ruminococceaceae UCG-005、Alloprevotella等与纤维消化有关的菌属丰度较高。肠道菌群的组成在生长的不同阶段是动态变化的。Beta多样性分析显示，同一日龄不同个体的物种多样性存在差异，尤其刚出生时(0 d)和断奶后(25 d)不同个体的物种多样性之间具有显著差异。说明仔猪肠道菌群的微生物组成在生长的不同阶段是动态变化的，且不同个体的物种多样性均有较大差异。

• 单位
  湖南农业大学