德宏奶水牛TLR8基因乳腺组织表达及生物信息学分析

作者：唐娜; 王梦迪; 彭虹菱; 张永云; 霍金龙; 杨忠^*; 李卫真^*

来源：饲料研究, 2021, 44(16): 69-72.

DOI：10.13557/j.cnki.issn1002-2813.2021.16.016

• 德宏奶水牛
• TLR8基因
• 基因表达
• 生物信息学

试验研究不同乳脂率德宏奶水牛乳腺组织中TLR8基因的表达规律及水牛TLR8的结构。利用乳品分析仪测定乳脂率,以7%～8%为中乳脂率组(M组),高于8%为高乳脂率组(H组),低于7%为低乳脂率组(L组)。采用实时荧光定量PCR技术检测TLR8基因表达量,与乳脂率进行相关性分析,利用生物信息学方法分析水牛TLR8的结构特征。结果表明,L组TLR8基因的表达量极显著高于H组和M组(P<0.01)。TLR8基因mRNA的表达水平与乳脂率呈显著负相关(P<0.05)。TLR8分子式为C5338H8275N1399O1567S31,分子质量为118 kD,理论等电点为5.90,亲水性总平均值为-0.134。TLR8属于跨膜蛋白,具有信号肽序列MTLRFLLLTSLFLLISDS,第18～19位氨基酸之间存在切割位点。TLR8的胞外区含有12个LRR、3个LRRTYP和1个LRRCT,胞内区具有1个TIR结构域。二级结构以α螺旋为主。TLR8主要与MyD88、IRAK1、IRAK4等蛋白相互作用。研究表明,水牛TLR8结构与TLR家族相似,且德宏奶水牛乳腺组织TLR8基因的表达量随着乳脂率增加呈下降趋势。

• 单位
  云南生物制药有限公司; 云南农业大学