茶陵野生稻冷响应基因OrCrGHl的表达与克隆

作者：莫香; 盛丽丽; 罗佳; 徐甜甜; 徐孟亮^*

来源：生命科学研究, 2023, 27(05): 377-384.

DOI：10.16605/j.cnki.1007-7847.2023.05.0154

• 野生稻
• 冷胁迫
• 基因芯片
• 实时定量PCR
• 基因克隆

为了发现新的水稻耐逆基因,采用水稻基因芯片分析了茶陵野生稻及籼型栽培稻培矮64S苗期全基因组在冷胁迫下的表达水平,从茶陵野生稻中筛选出一个强烈响应低温的耐冷候选基因,暂命名为Or CrGHl(Oryza rufipogon cold responsive glucan hydrolase-like)。用实时定量PCR方法对其表达水平进行了进一步的分析,所得结果与基因芯片分析结果基本吻合。以茶陵野生稻为材料,用逆转录PCR (reverse transcription PCR,RT-PCR)方法获得了包含其完整开放阅读框(open reading frame, ORF)的c DNA克隆。根据其ORF序列进行预测,该基因编码一个包含558个氨基酸残基的糖基水解酶相似蛋白质,其理论分子质量为59.252 kD, p I为5.81。经蛋白质相似性比对,其编码蛋白与日本晴第7号染色体上的LOC4343492基因编码的蛋白质(XP＿015647631.1,glucan endo-1,3-beta-glucosidase GII isoform X2)的氨基酸序列完全一致,与籼稻93-11预测蛋白质(EEC82204.1,hypothetical protein OsI＿26347)的相似性为99.28%。对其可能的启动子区域序列进行分析,发现了多个可能与逆境或逆境激素响应有关的顺式作用调控元件。以上结果提示,该基因为一新的野生稻耐冷候选基因,进一步的研究正在进行。

• 单位
  生命科学学院; 湖南师范大学