柠檬酸杆菌基因组多位点序列分型(in silico MLST)研究

作者：刘亚暖; 姜肇旭; 颜世敢^*

来源：齐鲁工业大学学报, 2023, 37(04): 55-60.

DOI：10.16442/j.cnki.qlgydxxb.2023.04.008

• 柠檬酸杆菌
• 基因组测序
• 多位点序列分型

对4株柠檬酸杆菌分离株进行全基因测序分析，并基于基因组序列进行16s rRNA、多位点序列分型(in silico MLST)及其遗传进化关系研究。对分离的4株柠檬酸杆菌进行全基因组测序，经拼接得到全基因组序列，然后进行16S rRNA物种鉴定、in silico MLST分析，并基于MLST分型构建遗传进化树，分析分离株的遗传进化关系。全基因组测序分析结果表明，柠檬酸杆菌的基因组大小介于4.771～5.477 Mb之间，平均为5.03 Mb;基因数量在4 591～5 334之间，平均为4 871个。16s rRNA分析结果表明，4株柠檬酸杆菌分离菌中有3株为布雷氏柠檬酸杆菌，1株为沃克曼氏柠檬酸杆菌。MLST分析结果表明，4株柠檬酸杆菌均是新的ST型。该研究分析了4株柠檬酸杆菌的基因组，基因组MLST分型分析表明4株分离菌均为新ST型，丰富了柠檬酸杆菌的菌种资源和遗传信息，为柠檬酸杆菌的防控、溯源奠定了基础。

• 单位
  山东省科学院; 齐鲁工业大学; 生物工程学院