摘要
Dirigent (DIR)蛋白参与木质素合成,在植物应对生物和非生物胁迫方面具有重要作用。枣树(Ziziphus jujuba Mill.)是鼠李科中经济价值最高的枣属植物之一。本研究通过生物信息学方法,基于全基因组数据对枣DIR基因家族成员进行鉴定,并对其编码蛋白的理化性质、基因结构、启动子元件、系统进化关系和蛋白相互作用网络预测进行解析。结果显示,在枣树基因组中存在37个ZjDIR编码基因,根据编码产物蛋白结构域的不同可分为6类:DIR-a、DIR-b/d、DIR-c、DIR-e、DIR-f和DIR-g。已明确其中有25个ZjDIR基因以不均匀方式分布在8条染色体上。ZjDIR基因之间的结构类似,不同亚族保守基序有差异。在染色体上的定位显示,ZjDIR家族基因存在14个串联复制基因对。ZjDIR基因启动子区域存在多种激素、干旱和低温等调控元件。在蛋白质相互作用预测和同源性比较的基础上,建立了由14个ZjDIR组成的蛋白质相互作用网络。本研究对37个已鉴定的ZjDIR基因进行了全面的生物信息学分析,串联复制是可能的进化驱动力,ZjDIR的蛋白-蛋白相互作用网络为进一步研究其生物学功能提供了有价值的线索。
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