基于转录组测序分析SPACA1在版纳微型猪近交系睾丸中的表达及转录调控特征

作者：刘志朋; 张霞; 代红梅; 杨福华; 廖隽锐; 许静; 霍金龙^*

来源：河北农业大学学报, 2023, 46(01): 88-96.

DOI：10.13320/j.cnki.jauh.2023.0013

• 精子顶体膜相关蛋白1
• 蛋白互作
• 功能分析
• ceRNA转录调控

旨在分析版纳微型猪近交系（Banna mini-pig inbred line,BMI）SPACA1基因的序列特征、生物学功能及在睾丸中的表达调控模式。选取4头成年BMI公猪的睾丸进行全转录组测序，获得SPACA1基因在睾丸中的表达丰度。采用RT-PCR技术克隆SPACA1的完整编码序列，分析SPACA1的序列、染色体定位、分子特征及相应蛋白的结构和功能。对SPACA1的相互作用蛋白进行GO、KEGG功能富集，并将获得的蛋白与转录组测序所获得的基因表达量进行关联分析。利用转录组测序数据构建SPACA1 mRNA与miRNA和lncRNA的ceRNA调控网络。SPACA1基因CDS区全长为888 bp(Genbank登录号：OK042308)，具有2个跨膜螺旋结构，与SPACA3、SPACA4、HIPK4和CCDC62显著相关；SPACA1及其互作蛋白主要参与精子细胞发育、分化，精子活力、顶体反应和精子鞭毛形成等通路；SPACA1基因受6个miRNAs靶向调控。本研究报道了SPACA1的表达、分子结构、蛋白质功能、在睾丸中的和转录调控作用，为深入研究SPACA1基因在BMI受精以及顶体反应等重要生物学过程中的功能奠定基础。

• 单位
  吕梁学院; 云南农业大学