摘要
目的研究2018年武汉地区手足口病(hand,foot and mouth disease,HFMD)肠道病毒病原谱分布特征,并对流行的主要型别肠道病毒基于VP1基因进行分子进化特征分析。方法采集2018年6-12月武汉市金银潭医院HFMD患儿肛拭子和咽拭子样本,应用real-time RT-PCR技术对肠道病毒阳性样本进行筛选后,采用RT-PCR法对肠道病毒VP1区部分基因扩增并进行序列分析;采用DNAStar 7.0、MEGA 6.0等软件进行核苷酸序列比对及基因种系进化特征分析。结果 2018年6-12月共收集疑似HFMD样本1 350份,检出肠道病毒阳性样本1 137份,阳性率84.22%。共检出11种不同型别的肠道病毒,柯萨奇病毒A组6型(coxsackievirus A6,CV-A6)、A10、A16、A2、A4和肠道病毒A组71型(enterovirus A71,EV-A71)分别占病原构成的50.57%、19.88%、11.08%、5.28%、4.66%和1.50%,其他5种肠道病毒型别为柯萨奇病毒B组5型(coxsackievirus B5,CV-B5)、CV-A5、Echo11、CV-A9和CV-B2,与未能定型肠道病毒合计占病原构成的7.04%。对流行的几种主要病原VP1区分析结果表明,武汉地区CV-A6、A10、A16、A2和A4基因亚型分别为D3、C、B1b、D2和E2。结论 2018年武汉地区HFMD病原谱为多种基因型的肠道病毒共同流行,CV-A6为优势病原体,以VP1为基础的进化树展示了CV-A6、A10、A16、A2和A4多变的进化分支,并表明了EV-A71疫苗干预下武汉地区肠道病毒传播的复杂情况。
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单位武汉生物制品研究所有限责任公司