番茄JAZ家族生物信息学及表达模式分析

作者:黄思源; 王海; 樊若晨; 李婉容; 李建君; 高苗苗; 于晓惠*; 陈银华*
来源:分子植物育种, 2022, 20(02): 377-389.
DOI:10.13271/j.mpb.020.000377

摘要

为明确番茄JAZ家族成员的特征,本研究以番茄JAZ家族基因为研究对象,对该家族成员的进化、复制、理化性质、表达模式等进行分析。结果显示,SlJAZs主要分布在番茄的7条染色体上,SlJAZ9、SlJAZ10和SlJAZ11可能在Chr.8上形成串联重复事件。SlJAZs基因结构分析结果显示,内含子数目变异比较大,位于1 (SlJAZ2)~14 (Sl JAZ12)之间。启动子分析结果表明,13个SlJAZs基因启动子顺式作用元件种类和数量存在差异,推测其各自的功能也存在差异。组织表达模式分析表明,SlJAZs基因在番茄在根、茎、叶、花、果间存在不同的表达特性。其中,SlJAZ2、SlJAZ4、SlJAZ6、SlJAZ7、SlJAZ8、SlJAZ11、SlJAZ12、SlJAZ13在花中表达量相对较高;SlJAZ5在根中表达量相对较高;Sl JAZ10在叶片和果中表达相对较高;SlJAZ11在叶片中表达量相对较低,说明SlJAZs基因可能在番茄发育的各个阶段发挥重要作用,本研究为进一步鉴定番茄JAZ的功能提供了参考。

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