基于高通量测序技术分析笼养熊猴肠道细菌菌群多样性

作者：木仁; 杨秉山; 楠田哲仕; 格根图雅; 吴艳梅; 陈春春; 岑光娇; 徐文斌^*

来源：黑龙江畜牧兽医, 2020, (19): 137-172.

DOI：10.13881/j.cnki.hljxmsy.2020.02.0075

• 熊猴
• 肠道菌群
• 高通量测序
• 16S rRNA
• 厚壁菌门

为了明确熊猴(Macaca assamensis)肠道菌群的组成,试验采用高通量测序技术对2只成年(雌雄各1只)和2只少年(雄性)笼养熊猴粪便中的细菌16S rRNA基因V3和V4区域扩增子进行分析。结果表明:本试验共获得460种OTUs聚类信息,每个样品平均(395.00±8.54)个。共注释到15个门,平均相对丰度高于1%的有4个,分别为厚壁菌门、拟杆菌门、变形菌门和螺旋体门,丰度分别为(61.66±8.47)%、(31.84±7.23)%、(3.16±1.09)%和(1.73±0.50)%。共注释到115个属,平均相对丰度高于1%的属有19个,其中占比最高的是乳酸杆菌属,其次为理研菌科RC9菌属和普雷沃菌属9,丰度分别为(14.61±3.17)%、(11.68±3.49)%和(8.69±1.03)%。笼养熊猴肠道菌群在少年雄性与成年雄性个体间差异较小,性别间差异相对较大。肠道微生物组成在门水平上与其他猕猴属基本一致,但在属水平上有较大差异。

• 单位
  黔南民族师范学院; 宁波大学