摘要

目的通过全基因组测序技术(whole genome sequencing,WGS)分析某三甲医院耐碳青霉烯肺炎克雷伯菌(carbapenem-resistant Klebsiella pneumonia,CRKP)的耐药基因分布及与耐药表型的关系,为临床治疗和防控提供参考。方法收集并鉴定临床分离非重复CRKP 28株。采用VITEK-2 compact全自动微生物鉴定药敏分析仪进行鉴定和药敏试验,使用全基因组测序技术进行测序。结果共检出47种耐药基因。其中碳青霉烯类耐药基因3种,主要为blaKPC-2基因(25株,89.29%),其次为blaNDM-5基因(2株,7.14%)和blaOXA-48基因(1株,3.57%);超广谱β-内酰胺酶(exterded spectrumβ-lactamases,ESBLs)耐药基因8种,主要为blaTEM-1、blaSHV-28、blaCTX-M-15和blaOXA-33,检出率分别为89.29%、75.00%、75.00%和67.86%;氨基糖苷类耐药基因10种,以AAC(6’)-Ib-cr和AAC(3)-IIa为主,检出率分别为71.43%和67.86%;喹诺酮类耐药基因4种,主要为oqxA和AAC(6’)-Ib-cr,检出率分别为85.71%和71.43%,其中20株CRKP同时携带oqxA和AAC(6’)-Ib-cr;磷霉素耐药基因1种,为FosA6,检出率为100%;磺胺类耐药基因3种,主要为sul2和sul1,检出率分别为21.43%和17.86%。28株CRKP的药敏结果显示,对碳青霉烯类抗菌药物、头孢菌素类、喹诺酮类和β-内酰胺类/β-内酰胺酶抑制剂合剂的耐药率均为100%;对阿米卡星的耐药率为14.29%,未检出替加环素耐药株。28株CRKP对所测β内酰胺类抗菌药物的耐药表型与耐药基因型完全一致。结论该院分离的CRKP同时携带多种抗菌药物的耐药基因,呈现泛耐药表型,其耐药表型和耐药基因型有很高的一致性。