基于特征挖掘与融合的剪接位点识别

作者:周艳红; 王卉; 杨雷
来源:华中科技大学学报(自然科学版)科技大学, 2006, (12): 117-120.
DOI:10.3321/j.issn:1671-4512.2006.12.038

摘要

在基于保守序列这一信号特征识别剪接位点的基础上,挖掘了可用于剪接位点识别的其他多个特征(包括剪接位点上、下游序列的碱基组成,剪接位点信号和上、下游序列的碱基组成随位点邻近序列C+G含量的变化等统计特征),建立了描述这些特征的模型,设计了能有效融合这些特征对剪接位点进行识别的对数线性模型,开发了剪接位点识别程序SpliceKey.测试结果表明:SpliceKey识别剪接位点的精度不仅较WAM方法有

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