7个桑树AP2/ERF转录因子的生物信息学及表达分析

作者：董亚茹; 李茹霞; 赵东晓; 耿兵; 孙景诗; 李云芝^*; 王照红

来源：山东农业科学, 2022, 54(01): 7-13.

DOI：10.14083/j.issn.1001-4942.2022.01.002

• 桑树
• AP2/ERF转录因子
• 生物信息学分析
• 基因表达
• 非生物胁迫

AP2/ERF类转录因子是植物所特有的一类转录因子家族,在植物的生长发育及响应非生物胁迫中发挥着重要作用。为发掘桑树AP2/ERF类转录因子的成员及其功能,从桂桑优12中克隆到7个AP2/ERF转录因子,命名为MnAP2/ERF1～MnAP2/ERF7。生物信息学分析结果表明,这7个AP2/ERF蛋白都属于不稳定蛋白,且均属于亲水性蛋白,二级结构以无规则卷曲为主,亚细胞定位显示主要位于细胞核中。氨基酸序列比对及进化树分析发现,这7个AP2/ERF转录因子均含有1个保守AP2结构域,其中MnAP2/ERF1～MnAP2/ERF4属于ERF亚家族,MnAP2/ERF5～MnAP2/ERF7属于DREB亚家族。荧光定量分析显示,NaCl、PEG6000、水淹胁迫可诱导7个桑树AP2/ERF基因上调表达,其中MnAP2/ERF3、MnAP2/ERF5、MnAP2/ERF6分别响应水淹、干旱和盐胁迫,说明桑树AP2/ERF转录因子的表达与逆境胁迫响应之间有密切的联系。本研究结果可为进一步揭示AP2/ERF转录因子调控桑树生长发育及逆境胁迫的机理奠定基础。

• 单位
  山东省蚕业研究所