分枝杆菌Rv2450c T细胞表位预测及分析

作者:王培东; 何俊才; 周放; 张露; 郑辉; 刘; 余晓丽
来源:武汉轻工大学学报, 2019, 38(01): 33-36.

摘要

对Rv2450c进行T细胞表位预测分析。在NCBI上获取Rv2450c蛋白质序列,运用ExPASY(ProtParam)对Rv2450c蛋白进行理化性质分析,Expasyde的Protscale程序对Rv2450c蛋白进行疏水性分析,NetMHC在线基本软件预测并分析Rv2450c的CD4+T细胞表位的分布情况; Bimas、NetMHC、和NetCTL软件预测并分析Rv2450c的CD8+T细胞表位的分布情况。经筛选得出CD4+T细胞的优势表位5个,CD8+T细胞优势表位2个;综合CD+T细胞表位与CD8+T细胞表位分析结果,最终筛选出T细胞表位预测为:SQGIRAWP159—166。预测出的T细胞候选表位可为结核病疫苗开发提供参考。