基于生物信息学分析B3GNT6作为胃癌早期诊断及预后生物标志物的研究

作者：史秋婷; 孙铭泽^*

来源：解剖科学进展, 2023, 29(04): 378-382.

DOI：10.16695/j.cnki.1006-2947.2023.04.012

• 胃癌
• 生物信息学
• B3GNT6
• O-Glycan

目的 通过生物信息学分析筛选出可以早期诊断及判断胃癌预后的生物标志物。方法 从GEO数据库获得GSE数据集，使用GEO2R在线工具筛选出差异表达基因(DEGs),应用基因本体论(GO)及京都基因和基因组数据库(KEGG)进行功能及通路富集分析，利用STRING、Cytoscape和cBioPortal分析出蛋白相互作用(PPI)网络、共表达基因及枢纽(Hub)基因。基于Kaplan-Meier分析预后生存曲线，使用HPA、Onco mine、UALCAN分析Hub基因在胃癌组织中的表达情况。结果 本研究共得到26个Hub基因，它们主要富集在O-聚糖(O-glycan)生物过程。Hub基因中生存分析显示B3GNT6和GATA6的GC患者总生存期较差。在TCGA中，B3GNT6在胃癌组织中表达明显下调，而GATA6表达无显著性差异。结论 B3GNT6可能作为潜在的胃癌早期诊断及判断预后的生物标志物。

• 单位
  中国医科大学附属第一医院