谷子SiSAP8基因的克隆及dCAPS标记开发

作者：王亦学; 郝曜山; 张欢欢; 董艳辉; 王晓清; 孙毅^*

来源：分子植物育种, 2020, 18(15): 4997-5002.

DOI：10.13271/j.mpb.018.004997

• 谷子(Setaria italica)
• SiSAP8
• 多态性
• dCAPS标记开发

谷子是中国北方重要的耐旱杂粮作物。胁迫相关蛋白是一类具有A20和(或) AN1结构域的锌指蛋白,广泛参与植物对非生物胁迫的响应。本研究从‘晋谷20’中克隆得到谷子SiSAP8基因,该基因编码区513 bp,编码170个氨基酸,分子量为18.20 kD,等电点为8.28,包含1个A20和1个AN1结构域。在对该基因序列进行多态性分析,共发现5个SNP位点和1个InDel,其中编码区有1处核苷酸变异位点(G/T)为非同义突变,使得缬氨酸变成了苯丙氨酸。利用第81位的SNP位点(A/G)开发了dCAPS标记,命名为‘SNP-81’,该标记的开发为后期功能鉴定及关联分析提供了依据。

• 单位
  山西省农业科学院生物技术研究中心