本文对高校治理所涉及的三个层次的利益关系可以基于委托代理理论进行经济学分析,并从博弈论的角度对不同关系中的代理人进行激励的必要性进行论证,最后提出针对高校机构涉及的委托代理关系。分别从科层制度、马斯洛需求层次理论以及自我实施合同三个角度进行激励机制设计,从而降低委托人的代理成本,有效地促进高校机构的改革和发展。