魔芋GDP-甘露糖焦磷酸化酶基因及其启动子的克隆与分析

作者:李鹏佳; 焦茂娟; 王启军; 苏承刚*
来源:西南大学学报(自然科学版), 2019, 41(03): 14-22.
DOI:10.13718/j.cnki.xdzk.2019.03.003

摘要

以花魔芋和白魔芋为材料,通过魔芋5个转录组高通量测序数据库,与拟南芥进行tBlastn比对、拼接,得到魔芋中的GDP-甘露糖焦磷酸化酶基因GMP的推定全长,设计基因特异性引物,克隆得到魔芋GMP基因的部分cDNA序列,长度为1 233 bp,其中基因编码区长度为1 086 bp,编码的氨基酸为361个.在此基础上运用FNPI-PCR技术得到了魔芋GDP-甘露糖焦磷酸化酶基因GMP上游启动子2 116 bp,经生物信息学分析,该序列具有典型的TATA-box、 CAAT-box及与胁迫相关的元件和光应答元件.

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