OHDSI通用数据模型在肿瘤大数据中的应用探索

作者:洪娜; 刘飞; 张梦阳; 张渝翔; 刘超; 张富博; 王芳; 唐燕平; 刘欢妹; 陈萌*
来源:中国数字医学, 2021, 16(11): 24-28.

摘要

目标:多类型的健康信息系统已成为基于真实世界数据的观察性临床研究的重要来源。本研究实践并验证了肿瘤大数据转化到"观察性健康医疗数据研究"项目(ObservationalHealthDataandInformatics,OHDSI)通用数据模型(Common Data Model,CDM)的可行性。方法:经过数据预处理、字段映射和自动脚本实现ETL。经人工审核校对后的映射关系被加载到CDM中形成标准化数据库。结果:来自于多家医院的肿瘤患者数据,被转换为OHDSI CDM所支持的标准化存储结构和标准化术语编码,以实现数据的互联互通。本研究重点示例了诊断、药品、手术与操作、检验类转化结果。结论:基于应用探索,我们认为OHDSI CDM在多中心数据整合分析方面具有较大优势,经过OHDSI框架标准化的数据可用于大规模观察性研究,然而,数据质控和数据标准化仍然是大数据分析面临的主要挑战。

  • 单位
    中国医学科学院北京协和医学院