多房棘球蚴葡萄糖转运蛋白抗原表位生物信息学预测

作者：王蕾; 魏威; 周培; 冯琳; 李润乐^*; 汤锋^*

来源：中国高原医学与生物学杂志, 2022, 43(03): 200-209.

DOI：10.13452/j.cnki.jqmc.2022.03.007

• 多房棘球蚴
• 葡萄糖转运蛋白
• 抗原表位
• T细胞
• B细胞

目的 通过对多房棘球蚴葡萄糖转运蛋白(Echinococcus multilocularis glucose transporter, EmGLUT)二级结构的分析，并结合在线工具来预测优势T细胞和B细胞抗原表位。方法 从NCBI-Gen Bank库中获取EmGLUT基因的mRNA和氨基酸序列。二级结构特征预测使用SOPMA软件。使用IEDB、Syfpeithi软件分析T细胞优势抗原表位，使用Bcepred、ABCpred软件分析B细胞优势抗原表位。结果 分析结果显示，在EmGLUT二级结构中α螺旋比例占51.08%,β折叠比例占17.88%,β转角比例占3.73%,无规则卷曲比例占27.31%。综合5个在线软件分析结果得出EmGLUT有10个T细胞优势抗原表位和18个B细胞优势抗原表位，其中5个同时具有T-B细胞双抗原表位。结论 EmGLUT的优势T细胞和B细胞抗原表位被成功预测。

• 单位
  青海大学