生长激素对感染J亚群禽白血病病毒的鸡胚成纤维细胞系的影响

作者：林玲; 莫国东; 吴强; 张细权^*

来源：基因组学与应用生物学, 2023, 1-19.

• 差异基因
• 生长激素(GH)
• J亚群禽白血病病毒(ALV-J)
• 转录组测序

生长激素(growth hormone， GH)不仅能调节动物的代谢、生长、发育和生殖，也能调节动物的免疫系统。本研究旨在通过转录组测序及生物信息学技术分析GH影响J亚群禽白血病病毒(subgroup J avian leukosis viruses， ALV-J)感染的鸡胚成纤维细胞系(Chicken fibroblast cells， DF-1)中的关键基因和信号通路。将空载和GH的过表达质粒分别转染至DF-1，接着均接种ALV-J毒株SCAU-HN06，采用转录组测序技术检测相关的基因表达谱变化。结果显示，与对照组相比，实验组中有上调差异表达基因(differentially expressed genes， DEGs)122个(49%)，下调DEGs 127个(51%)。通过基因本体(Gene ontology， GO)功能富集分析发现，DEGs主要富集于新陈代谢过程、生物调节、细胞过程、细胞部分、催化活性和结合等过程。经京都基因和基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of genes and genomes， KEGG)富集分析发现DEGs主要在免疫系统、信号转导、信号分子和相互作用、细胞生长和死亡等通路上富集。进一步构建蛋白质-蛋白质相互作用网络(protein-protein interaction networks， PPI)，筛选出7个免疫相关基因进行实时定量PCR验证，其中TRAF1、DSTYK、HESX1基因的表达趋势与转录组测序技术(RNA sequencing， RNA-seq)测序结果相一致。本研究通过生物信息学分析挖掘出可能参与调控ALV-J的关键基因和信号通路，以期为禽白血病病毒-宿主相互作用的关系提供新的见解，为禽白血病的净化提供新的思路。

• 单位
  动物科技学院; 华南农业大学